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| Registros recuperados : 625 | |
| 1. |  | ABREU, M. S. de; LOPES, M. T. G.; LOPES, R.; RAIZER, M. D. M.; FRAXE, T. de J. P.; AGUIAR, A. V. de. Florescimento e viabilidade de pólen de açaizeiros do Pará na Amazônia Ocidental. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020. Recursos genéticos e bioeconomia: inovação para um futuro sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020. Trabalho 559.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 4. | | ALMEIDA, D. P. de; SOUZA, S. F. de; FERREYRA RAMOS, S. L.; LOPES, R.; MENESES, C. H. S. G.; AGUIAR, A. V. de; WREGE, M. S.; LOPES, M. T. G. Projeção futura da distribuição natural e conservação de Catharanthus roseus. In: SIMPÓSIO DE MUDANÇA CLIMÁTICA E CONSERVAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS NA AMAZÔNIA, 2024, Manaus. Anais... Manaus: UFAM, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Florestas. |
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| 5. | | ALMEIDA, J. D. de; MOTTA, I. de O.; VIDAL, L. de A.; BÍLIO, J. F.; PUPE, J. M.; VEIGA, A. D.; CARVALHO, C. H. S. de; LOPES, R. B.; ROCHA, T. L.; SILVA, L. P. da; PIJOL-LUZ, J. R. P.; FREIRE, E. V. S. A. Bicho mineiro (Leucoptera coffeella): uma revisão sobre o inseto e perspectivas para o manejo da praga. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2020. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 372).| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | ALMEIDA, J. D. de; MOTTA, I. O.; VIDAL, L. A.; NASCIMENTO, E. F. M. B.; BILIO, J.; PUPE, J. M.; VEIGA, A. D.; CARVALHO, C. H. S. de; LOPES, R. B.; ROCHA, T. L.; SILVA, L. P. da; PUJOL-LUZ, J. R.; FREIRE, E. V. S. A. A comprehensive review of the coffee leaf miner leucoptera coffeella (lepidoptera: lyonetiidae): a major pest for the coffee crop in Brazil and others neotropical countries. Insects, v. 12, n. 12, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | ALMEIDA, R. F.; MEIRA, F. S.; GOMES, H. T.; BALZON, T. A.; BARTOS, P. M. C.; MEIRA, R. de O.; CUNHA, R. N. V. da; LOPES, R.; REIS, A. M. dos; PEREIRA, J. E. S. Capacity for somatic embryogenesis of adult oil palm genitors (Elaeis guineensis, var. Pisifera) from immature leaf tissues. South African Journal of Botany, v. 131, p. 229-239, July 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | ALMEIDA, R. F.; MEIRA, F. S.; GOMES, H. T.; LOPES, R.; CUNHA, R. N.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E. Embriogênese somática de genitores pisifera de dendezeiro (Elaeis guineensis Jacq. var. pisifera) a partir de explantes foliares de plantas adultas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | ALMEIDA, R. F.; MEIRA, F. S.; GOMES, H. T.; LOPES, R.; CUNHA, R. N.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E. Embriogênese somática de genitores pisifera de dendezeiro (Elaeis guineensis Jacq. var. pisifera) a partir de explantes foliares de plantas adultas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 10. | | ALMEIDA, R. F.; SANTOS, I. R.; MEIRA, F. S.; GRYNBERG, P.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; FRANCO, O. L.; PEREIRA, J. E. S.; REIS, A. M. dos. Differential protein profiles in interspecific hybrids between Elaeis oleifera and E. guineensis with contrasting responses to somatic embryogenesis competence acquisition. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, v. 137, p. 11-21, 2019. Na publicação: Jonny Everson Scherwinski-Pereira, Angela Mehta.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | ALMEIDA, R. F.; SANTOS, I. R.; MEIRA, F. S.; GRYNBERG, P.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; FRANCO, O. L.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E.; MEHTA, A. Differential protein profiles in interspecific hybrids between Elaeis oleifera and E. guineensis with contrasting responses to somatic embryogenesis competence acquisition. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, v. 137, p. 11-21, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 12. | | ALMEIDA, R. F.; SANTOS, I. R.; RIBEIRO, D. G.; LOPES, R.; CUNHA, R. N.; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E.; MEHTA, A. Análise proteômica em genótipos elites de palma de óleo (Elaeis guineensis Jacq. var. tenera) contrastantes quanto à aquisição de competência embriogênica. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória, ES. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: resumos. Brasília, DF: Sociedade Botânica do Brasil, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | ALMEIDA, R. F.; SANTOS, I. R.; RIBEIRO, D. G.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; SCHERWINSKI-PEREIRA, J. E.; MEHTA, A. Análise proteômica em genótipos elites de palma de óleo (Elaeis guineensis Jacq. var. tenera) contrastantes quanto à aquisição de competência embriogênica. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória, ES. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: resumos. Brasília, DF: Sociedade Botânica do Brasil, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 14. | | ALVES, F. S. F.; HOLANDA JUNIOR, E. V.; LOPES, R. dos S. Produção integrada de ovinos para corte no Ceará. In: ZAMBOLIM, L.; NASSER, L. C. B.; ANDRIGUETO, J. R.; TEIXEIRA, J. M. A.; KOSOSKI, A. R.; FACHINELLO, J. C. (org.). Produção integrada no Brasil: agropecuária sustentável alimentos seguros. Brasília, DF: Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Secretaria de Desenvolvimento Agropecuário e Cooperativismo, 2009. Cap. 25. p.763-778.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 17. | | ALVES, S. B.; LOPES, R. B.; TAMAI, M. A.; MOINO JUNIOR, A.; ALVES, L. F. A. Compatibilidade de produtos fitossanitarios com entomopatogenos em citros Laranja: Revista Tecnico-Cientifica de Citricultura, v.21, n.2, p.295-306, Cordeiropolis, SP, 2000| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 18. | | ALVES, S. R. M.; LOPES, R.; MENESES, C.; VALENTE, M. S. F.; MARTINS, C. C.; FERREYRA RAMOS, S.; OLIVEIRA, I.; FRAXE, T. de J. P.; COSTA, L.; LOPES, M. T. G. Morpho-agronomic characterization, sample size, and plot size for the evaluation of Capsicum chinense genotypes. Horticulturae, v. 8, n. 9, art. 785, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 19. | | ALVES, S. R. M.; OLIVEIRA, L. dos S.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; ROCHA, R. N. C. da. Características de frutos de acessos de pimenta de cheiro. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 162.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| Registros recuperados : 625 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/12/2018 |
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Data da última atualização: |
24/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 3 |
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Autoria: |
RIBEIRO, I. M.; BORGES, C. C. H.; SILVA, B. Z.; ARBEX, W. A. |
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Afiliação: |
WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL. |
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Título: |
A genetic programming model for association studies to detect epistasis in low heritability data. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista de Informática Teórica e Aplicada, v. 25, n. 2, p. 85-92, 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract The genome-wide associations studies (GWAS) aims to identify the most influential markers in relation to the phenotype values. One of the substantial challenges is to find a non-linear mapping between genotype and phenotype, also known as epistasis, that usually becomes the process of searching and identifying functional SNPs more complex. Some diseases such as cervical cancer, leukemia and type 2 diabetes have low heritability. The heritability of the sample is directly related to the explanation defined by the genotype, so the lower the heritability the greater the influence of the environmental factors and the less the genotypic explanation. In this work, an algorithm capable of identifying epistatic associations at different levels of heritability is proposed. The developing model is a aplication of genetic programming with a specialized initialization for the initial population consisting of a random forest strategy. The initialization process aims to rank the most important SNPs increasing the probability of their insertion in the initial population of the genetic programming model. The expected behavior of the presented model for the obtainment of the causal markers intends to be robust in relation to the heritability level. The simulated experiments are case-control type with heritability level of 0.4, 0.3, 0.2 and 0.1 considering scenarios with 100 and 1000 markers. Our approach was compared with the GPAS software and a genetic programming algorithm without the initialization step. The results show that the use of an efficient population initialization method based on ranking strategy is very promising compared to other models. MenosAbstract The genome-wide associations studies (GWAS) aims to identify the most influential markers in relation to the phenotype values. One of the substantial challenges is to find a non-linear mapping between genotype and phenotype, also known as epistasis, that usually becomes the process of searching and identifying functional SNPs more complex. Some diseases such as cervical cancer, leukemia and type 2 diabetes have low heritability. The heritability of the sample is directly related to the explanation defined by the genotype, so the lower the heritability the greater the influence of the environmental factors and the less the genotypic explanation. In this work, an algorithm capable of identifying epistatic associations at different levels of heritability is proposed. The developing model is a aplication of genetic programming with a specialized initialization for the initial population consisting of a random forest strategy. The initialization process aims to rank the most important SNPs increasing the probability of their insertion in the initial population of the genetic programming model. The expected behavior of the presented model for the obtainment of the causal markers intends to be robust in relation to the heritability level. The simulated experiments are case-control type with heritability level of 0.4, 0.3, 0.2 and 0.1 considering scenarios with 100 and 1000 markers. Our approach was compared with the GPAS software and a genetic programming algorithm without... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Computational Modeling; Genetic Programming; GWAS; Mathematical Modeling; Random Forest; SNP. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189322/1/Artigo-RevInfTeorApl.pdf
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Marc: |
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520 $aAbstract The genome-wide associations studies (GWAS) aims to identify the most influential markers in relation to the phenotype values. One of the substantial challenges is to find a non-linear mapping between genotype and phenotype, also known as epistasis, that usually becomes the process of searching and identifying functional SNPs more complex. Some diseases such as cervical cancer, leukemia and type 2 diabetes have low heritability. The heritability of the sample is directly related to the explanation defined by the genotype, so the lower the heritability the greater the influence of the environmental factors and the less the genotypic explanation. In this work, an algorithm capable of identifying epistatic associations at different levels of heritability is proposed. The developing model is a aplication of genetic programming with a specialized initialization for the initial population consisting of a random forest strategy. The initialization process aims to rank the most important SNPs increasing the probability of their insertion in the initial population of the genetic programming model. The expected behavior of the presented model for the obtainment of the causal markers intends to be robust in relation to the heritability level. The simulated experiments are case-control type with heritability level of 0.4, 0.3, 0.2 and 0.1 considering scenarios with 100 and 1000 markers. Our approach was compared with the GPAS software and a genetic programming algorithm without the initialization step. The results show that the use of an efficient population initialization method based on ranking strategy is very promising compared to other models.
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773 $tRevista de Informática Teórica e Aplicada$gv. 25, n. 2, p. 85-92, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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